Edition - Conversion de séquences |
 |
 |
Nom |
 |
Description |
 |
 |
Accès |
Web |
Unix |
Babel |
 |
 |
READSEQ
|
 |
Conversion de format d'une ou plusieurs séquences personnelles. |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
CONVSEQ
|
 |
Conversion de format de sequences de banques |
 |
 |
 |
- |
 |
 |
 |
INVCOMP
|
 |
Inversion-complémentation d'une séquence nucléique personnelle ou de banque (complète ou partielle). |
 |
 |
 |
- |
 |
 |
 |
REVERSE
|
 |
Protéine en code reverse |
 |
 |
 |
- |
 |
 |
 |
FEATGRP
|
 |
Représentation des features d'une séquence nucléique |
 |
 |
 |
- |
- |
 |
 |
USEBLAST
|
 |
Traitement, extraction des séquences d'une sortie blast |
 |
 |
 |
- |
 |
 |
 |
B2FX
|
 |
Parseur d'une sortie Blast |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
EDTALN
|
 |
Edition des séquences d'un alignement multiple.
Extraction des séquences (en partie ou en totalité), du consensus, des positions divergentes.
Calcul d'une matrice de distances. |
 |
 |
 |
- |
- |
 |
 |
ARTEMIS
|
 |
Editeur de séquences et outils d'annotation |
 |
 |
- |
 |
- |
 |
 |
FORMATDB
|
 |
A partir d'un fichier de séquences au format FASTA, formatdb génêre une mini-banque au format BLAST qui pourra alors être traitée par les programmes blastall, blastpgp ou MegaBLAST. Issu du package BLAST. |
 |
 |
- |
 |
- |
 |
 |