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Présentation des programmes d'analyse et traitement

Le serveur INFOBIOGEN propose un certain nombre de traitements classiques dans le domaine de la bioinformatique, tant sur des séquences personnelles que sur les séquences de banques : traduction, carte de restriction, recherche de motif, recherche de similitudes et alignements locaux, alignements globaux, phylogénie, conversion de formats (etc).

Ces programmes peuvent être lancés de différentes manières possibles : directe, à partir d'un menu ou dans le cadre d'un package, en mode anonyme ou authentifié.

Les packages sont des ensembles de programmes intégrés, avec une présentation, une navigation entre programmes et des modalités d'exécution et de manipulation des données spécifiques à chacun d'eux.

Trois grands types d'accès aux programmes sont proposés sur le serveur Infobiogen :
Via le serveur web d'Infobiogen
Interface web. Pas d'espace de travail personnel.
Accès en mode ligne
Accès authentifié à partir d'un compte sur la machine infobiogen.
Commandes unix en mode ligne (séquentiel).
Espace de travail personnel.
Via le serveur babel d'Infobiogen
Babel conjugue les 2 avantages : interface web associée à un espace de travail personnel.

 
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