Banques généralistes de séquences protéiques Nom Description Accès SRS FTP SWISSPROT Principale banque protéique avec Trembl et NBRF-PIR. Swissprot est maintenant intégrée dans la banque UNIPROT. uniprot uniprot_swissprot FTP PIR Protein Information Resource. Principale banque protéique, avec Swissprot. pir FTP TREMBL Séquences codantes (CDS) de l'EMBL au format Swissprot Trembl=Sptrembl+Tremblnew. Les séquences de Sptrembl et Sptremblnew seront, à terme, intégrées dans Swissprot. Celles en revanche de la banque Remtrembl (REMaining TREMBL) ne le seront pas. uniprot uniprot_trembl FTP GENPEPT Séquences codantes (CDS) de GenBank. genpept genpeptrelease genpeptnew FTP REFSEQP Ensemble de séquences de référence pour l'annotation fonctionnelle du génome humain. refseqp refseqpnew refseqprelease FTP IPI International Protein Index est une banque protéomique humaine et de souris construite sur des données de Ensembl, SWISS-PROT/TrEMBL et RefSeq. ipi FTP NRL3D La banque NRL_3D est produite par PIR : elle correspond aux séquences et annotations associées extraites de la banque PDB. nrl3d FTP KABATP Séquences d'immunoglobulines. kabatp kabatn kabatn+kabatp FTP UNIPROT (Universal Protein Resource). Cette banque intègre Trembl et swissprot. uniprot uniprot_swissprot uniprot_trembl FTP DECRYPTON Base de données résultant de la première comparaison exhaustive des protéines du monde vivant. FTP

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