Banques de données biologiques

II. BANQUES DE DONNÉES BIOLOGIQUES 1. Banques de séquences 2. Mode opératoire 3. Interrogation et intégration

La bioinformatique est le traitement automatique de l'information biologique, sous forme de données. La base de données (données primaires) est donc la matière première à partir de laquelle la bioinformatique va produire d'autres données (données secondaires) et construire de nouvelles connaissances

Les données, à la fois produites et traitées par la bioinformatique, sont schématiquement de cinq natures différentes :

Les séquences Données de séquences nucléiques et protéiques Les données cartographiques Localisation des gènes et marqueurs sur les chromosomes . Données issues de la cartographie physique , génétique et transcriptionnelle Ex : GDB , GENATLAS Les données structurales Données correspondant aux structures 3D des biomolécules : des séquences nucléiques Ex: La NDB des séquences protéiques Ex: La PDB Les données d'expression Données issues de l'analyse de l' expression génique (analyse des ARNm : ADNc et EST ). Les données génomiques Données par génome . Les données fonctionnelles Données métaboliques issues de la génomique fonctionnelle .