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Accueil Documents : Standards - Noms des banques utilisés dans EMBOSS

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Noms des banques utilisés dans EMBOSS
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    EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite
                       Release 3.0.0   15/07/2005
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GENBANK				Release 151 (12/05)
	ALL (gb:*)		NEW (gbnew:*) Daily updated
	EST (gbest:*)		GSS (gbgss:*)		HTC    (gbhtc:*)
	HTG (gbhtg:*)		STS (gbsts:*)     	plant  (gbpln:*)
        unannotated (gbuna:*)      synthetic (gbsyn:*)  human  (gbpri:*)
	environmental (gbenv:*)	   patented  (gbpat:*)	phage  (gbphg:*)
	invertebrate (gbinv:*)	   bacterial (gbbct:*)  rodent (gbrod:*)  
	other vertebrate (gbvrt:*) mammalian (gbmam:*)  viral  (gbvrl:*)
        WGS (gbwgs:*) Whole Genome Shutgun  Weekly updated
        TPA (gbtpa:*) Third Party Annotation

EMBL				Release 85  (12/05)
	ALL (em:*)		NEW (emnew:*) Daily updated
	EST (emest:*)   [fun=fungi hum=human mus=mouse pro=prokaryotes]
            (emestfun:* emesthum:* emestinv:* emestmam:* emestmus:*
             emestpln:* emestpro:* emestrod:* emestvrt:*)
 	GSS (emgss:*)
	    (emgssfun:* emgsshum:* emgssinv:* emgssmam:* emgssmus:*
             emgsspln:* emgsspro:* emgssrod:* emgssvrt:*)
	HTG (emhtg:*)
	    (emhtghum:* emhtginv:* emhtgmam:* emhtgmus:* emhtgpln:* 
             emhtgrod:* emhtgvrt:*)
        WGS (emwgs:*) Whole Genome Shutgun NEW (wgsnew:*) Daily updated
        TPA (emtpa:*) Third Party Annotation

REFSEQ				Release 15  (01/06)	
	ALL NUC. (refseq:*)	ALL PROT. (refseqp:*)
	ALL NEW  (refnew:*)	ALL PROT. NEW (refpnew:*) Daily updated

IMGT    (imgt:*)                IMGTHLA (imgthla:*)      Weekly updated 

UNIPROT    NR SWISSPROT+SPTREMBL  (uniprot:*  sw:* tr:*) Weekly updated
PIR/NBRF   Release 80 (01/05)     (pir:*) 
IPI	   (ipi:*) (ipihuman:* ipimouse:* ipirat:*)     Weekly updated
GENPEPT	   Release 151 (12/05) ALL (gp:*) NEW (gpnew:*) Daily updated

REBASE  Restriction Enzymes             Monthly updated
PROSITE CUTG(CODONS)                    Monthly updated
PRINTS  Release 38 (06/05)              PFAM Release 19 (12/05)                    

**********************************************************************
Menu of EMBOSS applications:              emnu
List of program names and descriptions    wossname -alphabetic
List of DataBanks			  showdb	
Help on a program:                        program_name -help
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