Tables et codes des acides aminés et nucléotides

Code des acides aminés Code génétique standard Code dégénéré des nucléotides Code de Staden Code dégénéré de Staden

Code des acides aminés

Symbole Code 3c AA Codons Code IUB A Ala Alanine GCT,GCC,GCA,GCG GCX B Asp,Asn Aspartic,Asparagine GAT,GAC AAT,AAC RAY C Cys Cysteine TGT,TGC TGY D Asp Aspartic GAT,GAC GAY E Glu Glutamic GAA,GAG GAR F Phe Phenylalanine TTT,TTC TTY G Gly Glycine GGT,GGC,GGA,GGG GGX H His Histidine CAT,CAC CAY I Ile Isoleucine ATT,ATC,ATA ATH K Lys Lysine AAA,AAG AAR L Leu Leucine TTG,TTA CTT,CTC,CTA,CTG TTR,CTX YTR;YTX M Met Methionine ATG ATG N Asn Asparagine AAT,AAC AAY P Pro Proline CCT,CCC,CCA,CCG CCX Q Gln Glutamine CAA,CAG CAR R Arg Arginine CGT,CGC,CGA,CGG AGA,AGG CGX,AGR,MGR;MGX S Ser Serine TCT,TCC,TCA,TCG AGT,AGC TCX,AGY;WSX T Thr Threonine ACT,ACC,ACA,ACG ACX V Val Valine GTT,GTC,GTA,GTG GTX W Trp Tryptophan TGG TGG X Xxx Unknown - XXX Y Tyr Tyrosine TAT,TAC TAY Z Glu,Gln Glutamic,Glutamine GAA,GAG CAA,CAG SAR * End Stop TAA,TAG,TGA TAR,TRA;TRR

Code génétique standard

. T C A G . T TTT Phe F TCT Ser S TAT Tyr Y TGT Cys C T TTC Phe F TCC Ser S TAC Tyr Y TGC Cys C C TTA Leu L TCA Ser S TAA Stop TGA Stop A TTG Leu L TCG Ser S TAG Stop TGG Trp W G C CTT Leu L CCT Pro P CAT His H CGT Arg R T CTC Leu L CCC Pro P CAC His H CGC Arg R C CTA Leu L CCA Pro P CAA Gln Q CGA Arg R A CTG Leu L CCG Pro P CAG Gln Q CGG Arg R G A ATT Ile I ACT Thr T AAT Asn N AGT Ser S T ATC Ile I ACC Thr T AAC Asn N AGC Ser S C ATA Ile ACA Thr T AAA Lys K AGA Arg R A AUG Met M ACG Thr T AAG Lys K AGG Arg R G G GTT Val V GCT Ala A GAT Asp D GGT Gly G T GTC Val V GCC Ala A GAC Asp D GGC Gly G C GTA Val V GCA Ala A GAA Glu E GGA Gly G A GTG Val V GCG Ala A GAG Glu E GGG Gly G G

Code dégénéré des nucléotides

IUB/GCG Base Complement Staden Stanford A A T A A C C G C C G G C G G T/U T A T T/U M A ou C K 5 J R A ou G Y R R W A ou T W 7 L S C ou G S 8 M Y C ou T R Y Y K G ou T M 6 K V A ou C ou G B non supporté N H A ou C ou T D non supporté N D A ou G ou T H non supporté N B C ou G ou T V non supporté N X/N G ou A ou T ou C X -/X N . ni G ni A ni T ni C . non supporté ?

Code de Staden

Code Staden Base GCG 1 C c 2 T t 3 A a 4 G g D C ou CC c V T ou TT t B A ou AA a H G ou GG g K C ou CX c L T ou TX t M A ou AX a N G ou GX g

Code dégénéré de Staden

Symbole Base c c t t a a g g 1 Probablement c 2 Probablement t 3 Probablement a 4 Probablement g d Probablement c - Possiblement cc v Probablement t - Possiblement tt b Probablement a - Possiblement aa h Probablement g - Possiblement gg k Probablement c - Possiblement c- l Probablement t - Possiblement t- m Probablement a - Possiblement a- n Probablement g - Possiblement g- r a ou g y c ou t 5 a ou c 6 g ou t 7 a ou t 8 g ou c - a ou g ou c ou t A a C c G g T t * caractère de remplissage attribué par auto assembleur sinon = -