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Accueil Compte Infobiogen - FAQ : à propos d'un compte Infobiogen

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FAQ : à propos d'un compte Infobiogen

Connexion
- Quels sont les différents modes de connexion possibles sur votre machine ?
- Je n'arrive pas à me connecter : pourquoi ?
Mot de passe
- J'ai oublié mon mot de passe ...
- Comment changer mon mot de passe ?
Compte Infobiogen
- Quels sont les espaces dont je dispose sur la machine infobiogen ?
    et lovelace) ?
- Comment connaître l'espace utilisé sur mon compte ?
- Comment tarer tout un répertoire en un seul fichier ?
- Comment détarer un fichier ?
- Comment copier un fichier d'un compte sur un autre compte ?
    D'une machine sur une autre machine ?
Messagerie
- Je dispose d'un compte à Infobiogen. Ai-je un e-mail sur votre machine ?
- Comment puis-je lire mon courrier depuis mon compte infobiogen ?
- Quelle adresse dois-je indiquer dans mon lecteur de messages pour le courrier
    entrant ?
- Comment rediriger des messages reçus ?
- Comment éviter les spams ?
- Où sont archivés mes messages ?
Demande d'informations
- Je rencontre tel ou tel problème. A qui m'adresser ?
Connexion
Quels sont les différents modes de connexion possibles sur votre machine ?

Trois types de connexion sont possibles :
Via le serveur ftp en mode anonyme : ftp://ftp.infobiogen.fr/
En mode ssh (Secure SHell) : protocole permettant d'ouvrir une session sécurisée sur la machine infobiogen.
Je n'arrive pas à me connecter : pourquoi ?

Trois raisons principales peuvent expliquer l'échec d'une connexion :
Le mot de passe a expiré : demandez un nouveau mot de passe à Infobiogen. Celui-ci est valide un an après le dernier changement.
Les quotas du compte sont dépassés : le ménage sur le compte est necessaire ...
La configuration ssh n'est plus la bonne (celle-ci doit être configurée au port 22)
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Mot de passe
Comment changer mon mot de passe ?

Pour changer le mot de passe de votre compte, utilisez la commande unix passwd .
Le mot de passe doit contenir au moins 8 caractères (chiffres, lettres majuscules ou minuscules, symboles) avec au moins un caractère de ponctuation.
J'ai oublié mon mot de passe ...

Il suffit d'envoyer un message à l'adresse : bioinfo@infobiogen.fr et de demander un nouveau mot de passe en précisant votre login.
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Compte Infobiogen
Quels sont les espaces dont je dispose sur la machine infobiogen ?

L'ouverture d'un compte Infobiogen donne droit à deux espaces personnels différents :
un home directory sur la machine babbage (prompt de la machine : babbage$), à partir duquel sont accessibles toutes les applications en bioinformatique.
Celui-ci est couplé à un espace de travail ( ws : working space) dans lequel peuvent être stockés temporairement de gros fichiers.
un espace personnel stockant la messagerie du compte (/var/spool/pub/mail, équivalente en terme de syntaxe à /var/mail)
Comment connaître l'espace utilisé sur mon compte ?

La commande unix appropriée est :
$ quota -v

Elle vous indique l'usage en cours des fichiers soumis à quotas.

Le système retourne alors l'état des ressources (espace et nombre de fichiers) pour les 3 espaces personnels suivants : home_dir sur la machine babbage (/_/home01/_), ws et projets sur la machine babbage (/_/ibg01/_) et l'espace messagerie (/var/spool/pub/mail) sur la machine lovelace.

Sont indiquées : les valeurs d'usage (sous les libellés usage et files), les valeurs limites d'usage permanent (quota) et le dépassement autorisé (limit timeleft) pour 7 jours.
A titre d'exemple :

Disk quotas for  (uid 5700):
Filesystem  usage   quota   limit timeleft files  quota  limit time
/_/home01/_   859   50000   80000             15  10000  20000
/var/spool/pub/mail      
               19   30000   60000              1     32     48
/_/ibg01/_   1446 2000000 4000000             41  40000  60000
Comment tarer tout un répertoire (et ses sous-répertoires) en un seul fichier ?

Pour tarer, lancez la commande unix :
tar -cvf nom_du_fichier_resultat_du_tar nom_du_repertoire_a_tarer

Pour vérifier le résultat du tar, lancez la commande :
tar tvf nom_du_fichier_resultat_du_tar

Pour détarer :
tar xpf nom_du_fichier_resultat_du_tar

Comment copier un fichier d'un compte sur un autre compte ? D'une machine sur une autre machine ?

Pour cela, utilisez la commande SCP (Secure CoPy) [ftp authentifié sécurisé].
(Voir : man scp).
scp   [[user@]host1:]file1   [[user@]host2:]file2

Ex : scp fichier.dat martin@babbage:repertoire_destination

La copie sera affective après demande du mot de passe.

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Messagerie
Je dispose d'un compte à Infobiogen. Ai-je un e-mail sur votre machine ?

A tout compte ouvert correspond une adresse de messagerie :
e-mail : login@infobiogen.fr
ou (autre syntaxe équivalente) :
e-mail : Prenom.Nom@infobiogen.fr@infobiogen.fr (sans accents)
Comment puis-je lire mon courrier depuis mon compte infobiogen ?

Deux lecteurs de courrier électronique sous unix sont disponibles sur la machine babbage :

babbage$ mutt (Voir : man mutt)
babbage$ pine (Voir : man pine)

Pour plus de détails, voir leur configuration .

Quelle adresse dois-je indiquer dans mon lecteur de messages pour le courrier entrant ?

Pour utiliser un lecteur de messages depuis un poste windows ou MacOS (type eudora ...), l'adresse pour le courrier entrant sur ce poste est : mailhost.infobiogen.fr
Pour le courrier sortant, utiliser le serveur smtp de votre Fournisseur d'Accès Internet ou de votre centre de recherche.
Comment rediriger des messages reçus ?

Pour rediriger les messages reçus à une adresse 1 vers une adresse 2, créer, dans le répertoire racine (home directory) du compte 1, un fichier .forward dans lequel figurera uniquement l'adresse2.
Pour cela, vous pouvez utilisez la commande unix toute simple :
echo dupond@site.ext.fr > .forward

Puis modifiez les protections du fichier de la façon suivante :
chmod 644 .forward

Comment éviter les spams ?

Infobiogen se met au service d'une large communauté d'utilisateurs. Certaines informations publicitaires peuvent intéresser seulement une partie de cette communauté. Toutefois, Infobiogen filtre les courriers entrants contre les Spam fréquents (Bogofilter). Les spams sont stockés dans la mailbox 'spam.mbox' sur le serveur.
Par ailleurs, vous pouvez rediriger vos messages (via le .forward) sur le serveur de messagerie de votre centre de recherche de manière à bénéficier des dispositions mis en oeuvre par celui-ci en la matière.
Où sont archivés mes messages ?

Le courrier est stocké temporairement dans le système de fichiers var/spool/pub/mail/, équivalente en terme de syntaxe à /var/mail.
Ainsi, au compte dont le login est martin, le courrier associé sera stocké dans l'espace /var/mail/martin.

Normalement, lors de la lecture des mails par "popper", les messages sont supprimés du fichier /var/mail/login, SAUF si l'option "conserver sur le serveur" a été choisie.

Si les messages sont lus sur les serveurs d'Infobiogen, et sauvegardés avec l'option du lecteur de courrier utilisé, il seront archivés dans le repertoire principal du compte de la machine lovelace (home dir/Mail).

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Demande d'information
Je rencontre tel ou tel problème. A qui m'adresser ?

Selon le problème rencontré, trois adresses électroniques sont à votre disposition :
bioinfo@infobiogen.fr : problème de toute nature (connexion, mot de passe, question sur les programmes, sur les banques de données maintenues à Infobiogen, etc)
secretariat@infobiogen.fr : problème d'ordre administratif
web@infobiogen.fr : problème rencontré sur le serveur web d'Infobiogen (ou suggestion, remarque, etc).

 
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