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SRS
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(Sequence Retrieval System).
Logiciel créé par Thure Etzold et proposé par de nombreux sites serveurs : il permet une interrogation simple ou croisée sur un éventail large de bases en biologie moléculaire. Chaque site SRS propose un ensemble spécifique de bases données. |
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 SRS Documentation
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Databanks Available
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Interrogation GETZ
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(Mode commande ligne sous UNIX
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List of all SRS servers
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Liste des serveurs SRS6 publics. En outre, un tableau indique pour chaque base de données proposée sous SRS6 les pages d'interrogation des serveurs associés. |
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SRS de l'EBI
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Databanks Available
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SRS de Sanger Centre
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Databanks Available
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SRS du CAOS
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(Pays-bas) |
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Databanks Available
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SRS de Wehi
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(Australie) |
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Databanks Available
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ENTREZ
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(NCBI WWW Entrez Browser) : interrogation des séquences moléculaires de Medline, GenBank, EMBL, DDBJ, PIR, SwissProt, PRF et PDB. |
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WWW Entrez Help
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The WWW Entrez Databases
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Nucleotides
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Proteins
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3-D structures
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Genomes
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PubMed
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Système d'interrogation des banques EMBL, Genbank, Swissprot, PIR, PRF, LITDB, PDB, PDBSTR, EPD, Prosite, Ligand, PMD, AA-Index, OMIM. (GenomeNet, Japon) |
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(full text search)
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: recherche dans les banques de séquences et génomes.
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Interface à DBGET/KEGG/BLAST/FASTA |
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ACNUC
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Système d'interrogation (au choix) des banques EMBL, Genbank, PIR, Hovergen (Homologous Vertebrate Genes Data Base), NRSub (Bacillus subtilis), NRBact (Haemophilus et Mycoplasma) et Sptrembl. (PBIL, Pôle Bio-Informatique Lyonnais) |
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Query a data bank
: requête ACNUC.
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Modify a sequence
modification d'un ensemble de séquences présélectionnées par la requête.
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Species browser
: recherche du taxon (critère de sélection possible dans la requête).
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ATLAS
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Recherche simultanée dans GenBank, EMBL, SwissProt et PIR à partir de mots-clefs ou d'une portion de séquence (de 3 à 30 caractères) (MIPS, US) |
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Bio-mirror
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(public service for high-speed access to biosequence data). (IUBio, Indiana University, US) |
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IUBio Biosequences section
: recherche de mots-clés simultanément sur plusieurs banques.
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Biologists Search Palette
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(Bioinformatics Centre, Oxford University, UK) |
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Requêtes périodiques automatisées
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ALERT (help)
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Utilitaire qui permet d'ètre informé une fois par semaine, par mail, des nouvelles séquences nucléiques (GenBank, EMBL) et/ou protéiques ( SwissProt, PIR) relatives à un domaine d'intérêt particulier (selon un "profil personnalisé" donné) (MIPS, USA). |
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ALERT
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Swiss-Shop
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Recherche automatique hebdomadaire dans les news de la banque SwissProt : soit d'un profil, soit d'un pattern protéique (au format PROSITE), soit des séquences homologues à une séquence donnée (par BLAST). (ExPASy). |
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Create and Send a Swiss-Shop Request
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Sequence Alerting System
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Recherche BLAST automatique quotidienne dans les news de plusieurs banques des séquences homologues d'une séquence donnée. Réponses par e-mail. (The Bork group, Biocomputing Unit, EMBL, Allemagne) |
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PubCrawler
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(An Update Alerting Service for PubMed and GenBank). Recherche automatique quotidienne dans la base Pubmed du NCBI d'un profil défini. (Department of Genetics, Trinity College, Dublin, Ireland). |
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PubCrawler's WWW-Service
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Current Medline Scanner
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Recherche automatique hebdomadaire d'un profil défini dans la base Pubmed du NCBI. (réceptiom par e-mail). (Weizmann Institute for Science, Israel). |
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BioMail
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Recherche automatique d'un profil défini dans la base Pubmed du NCBI. |
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