transeq

Programme permettant de fusionner un ensemble de sequences
presentes dans un fichier sequentiel, en  une sequence unique

sqx> transeq
 Sequences extraites dans un fichier personnel :
          Format micro (; et //)            (M)
          Format texte (rien)               (S)
          Format FASTA (>)                  (F)
          Defaut                         [F]

 NOM DU FICHIER EN SORTIE ?     (16 CAR MAX)   RETURN=FIN
tt
 CE FICHIER EXISTE DEJA :
 VOULEZ-VOUS :  (1) designer un autre nom
                (2) ecraser les dernieres versions par la nouvelle
                (3) creer une version supplementaire
2

 Nom de la sequence en ecriture
AMPc.RDM
 Nom du fichier de lecture (fasta)
AMPc.RDM.tfa
   1tps3               1003
   2tps1               1003
   3sur1               1003
   4mdh2               1003
   5mbr1               1003
   6hxk1               1003
   7gph1               1003
..
   35tkl2               1003
   36ybr149w            1003
Date = 21-Jul-97  Heure = 17:02:15  Temps ecoule =    9.16 (s)

sqx> more tt
>AMPc.RDM               1   36108
GTTTCCTTGGAGCCTGTGTACGAATGTAAACATATCTTGACAGAGTGATACGTCAAGAGC
TCTTCATTGCAGATATCGTTTAGTTTCCCGTGGCACTTTACATCGTGTATAGAGATGGGC