CE PROGRAMME PERMET DE TRANSFERER LES SEQUENCES SELECTIONNEES GRACE AU LOGICIEL DE REQUETES ACNUC SUR LES BANQUES DE SEQUENCES UNE EXTRACTION DE SEQUENCES PERSONNELLES PEUT AUSSI ETRE UTILISEE - IL EST DEMANDE DE SAISIR: - LE MODE DE FORMAT DE SORTIE (Micro ou FASTA) LE TYPE DE SEQUENCES (GENBANK, EMBL, NBRF, PERSONNELLE) LE NOM DU FICHIER D EXTRACTION (RETURN = FIN) LE MODE DE TRANSFERT SEQUENCE TOTALE 0 SEQUENCE QUTOUR D UNE POSITION 1 SEQUENCE ENTRE 2 POSITIONS 2 - CONFIRMATION DE LA TRANSMISSION RETURN = OUI , SAISIE DE F = RETOUR AU MENU - REMARQUES. LES SEQUENCES EXTRAITES SONT TRANSMISES DE FACON SEQUENTIELLE EN UNE SEULE FOIS. 2 MODES DE SORTIE SONT POSSIBLES : MODE "MICRO" ELLES DEBUTENT PAR UNE LIGNE : AVEC UN ';' EN PREMIER CARACTERE SUIVI DU MNEMONIQUE ET DE LA LONGUEUR ELLES SONT SEPAREES LES UNES DES AUTRES PAR UNE LIGNE AVEC '//' MODE FASTA AVEC UN '>' EN PREMIER CARACTERE SUIVI DU MNEMONIQUE ET DE LA LONGUEUR DANS LE CAS DE DEFINITION DE POSITION(S) , LES VALEURS NUMERIQUES DOIVENT ETRE SEPAREES PAR UN ESPACE APRES LE MNEMONIQUE - 1) FORMAT MICRO : SEQUENCES PRECEDEES DE 1 LIGNE DEBUTANT PAR ';' ET MNEMONIQUE ET SE TERMINANT PAR UNE LIGNE '//' 2) FORMAT FASTA (COMPATIBLE AVEC CLUSTAL) : SEQUENCES PRECEDEES DE 1 LIGNE DEBUTANT PAR '>' ET MNEMONIQUE CE FICHIER PEUT SERVIR DE FICHIER D ENTREE POUR LES ALIGNEMENTS MULTIPLES AVEC LE PROGRAMME CLUSTAL. IL EST AUSSI POSSIBLE D UTILISER CE FICHIER SEQUENTIEL CREE POUR FAIRE UNE ANALYSE DE SIMILITUDE AVEC LE PROGRAMME FASTA SYNTAXE : fasta fichier_sequence fichier_sequentiel ktupl >fichier_res tfasta fichier_sequence fichier_sequentiel ktupl >fichier_res avec : fichier_sequence : votre sequence personnelle q compqrer fichier_sequentiel: le fichier sequentiel contenqnt les sequences extraites au format FASTA ktupl : de 4 a 6 pour les ac. nucleiques 1 ou 2 pour les sequences de proteines fichier_res : fichier de sortie contenant les resultats sans definition : sortie au terminal