CE PROGRAMME PERMET DE TRANSFERER LES SEQUENCES SELECTIONNEES GRACE AU
LOGICIEL DE REQUETES ACNUC SUR LES BANQUES DE SEQUENCES UNE EXTRACTION
DE SEQUENCES PERSONNELLES PEUT AUSSI ETRE UTILISEE
-
      IL EST DEMANDE DE SAISIR:
-
         LE MODE DE FORMAT DE SORTIE (Micro  ou FASTA)
         LE TYPE DE SEQUENCES (GENBANK, EMBL, NBRF, PERSONNELLE)
         LE NOM DU FICHIER D EXTRACTION (RETURN = FIN)
         LE MODE DE TRANSFERT 
                      SEQUENCE TOTALE                 0
                      SEQUENCE QUTOUR D UNE POSITION  1
                      SEQUENCE ENTRE 2 POSITIONS      2
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      CONFIRMATION DE LA TRANSMISSION
                      RETURN = OUI  , SAISIE DE F = RETOUR AU MENU
-
   REMARQUES.
         LES SEQUENCES EXTRAITES SONT TRANSMISES DE FACON SEQUENTIELLE
         EN UNE SEULE FOIS.
         2 MODES DE SORTIE SONT POSSIBLES :
         MODE "MICRO"
           ELLES DEBUTENT PAR UNE LIGNE :
            AVEC UN ';' EN PREMIER CARACTERE SUIVI DU MNEMONIQUE
            ET DE LA LONGUEUR
           ELLES SONT SEPAREES LES UNES DES AUTRES
               PAR UNE LIGNE AVEC '//'
         MODE FASTA
            AVEC UN '>' EN PREMIER CARACTERE SUIVI DU MNEMONIQUE
           ET DE LA LONGUEUR

         DANS LE CAS DE DEFINITION DE POSITION(S) , LES VALEURS
         NUMERIQUES DOIVENT ETRE SEPAREES PAR UN ESPACE APRES LE
         MNEMONIQUE
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1) FORMAT MICRO :
  SEQUENCES PRECEDEES DE 1 LIGNE DEBUTANT PAR ';' ET MNEMONIQUE
  ET SE TERMINANT PAR UNE LIGNE '//'
2) FORMAT FASTA (COMPATIBLE AVEC CLUSTAL) :
  SEQUENCES PRECEDEES DE 1 LIGNE DEBUTANT PAR '>' ET MNEMONIQUE
  CE FICHIER PEUT SERVIR DE FICHIER D ENTREE POUR LES ALIGNEMENTS
  MULTIPLES AVEC LE PROGRAMME CLUSTAL.

  IL EST AUSSI POSSIBLE D UTILISER CE FICHIER SEQUENTIEL CREE POUR
  FAIRE UNE ANALYSE DE SIMILITUDE AVEC LE PROGRAMME FASTA
  SYNTAXE :
      fasta   fichier_sequence    fichier_sequentiel   ktupl >fichier_res
     tfasta   fichier_sequence    fichier_sequentiel   ktupl >fichier_res

avec :
        fichier_sequence  :  votre sequence personnelle q compqrer
        fichier_sequentiel:  le fichier sequentiel contenqnt les 
                             sequences extraites au format FASTA
        ktupl             :  de 4 a 6 pour les ac. nucleiques
                             1 ou 2  pour les sequences de proteines
        fichier_res       :  fichier de sortie contenant les resultats
                             sans definition  : sortie au terminal