CE PROGRAMME PERMET D ALIGNER DE FACON ACCELEREE DEUX SEQUENCES EN NE
  TENTANT DES ALIGNEMENTS QUE DANS LES REGIONS OU UN NOMBRE DONNE (KTPL)
  DE BASES CONSECUTIVES SONT HOMOLOGUES. DE PLUS LA LONGUEUR DES
  INSERTIONS POSSIBLES EST LIMITEES A UNE VALEUR PARAMETRABLE (NW)
  LA LONGUEUR DES SEQUENCES EST LIMITEE A 3000 NUCLEOTIDES.
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  APRES AVOIR DONNE LE NOM DE VOS SEQUENCES VOUS EST POSEE LA QUESTION.
  CHANGE PARAMETERS? (O/N/H)
  SI VOUS REPONDEZ N VOUS CONSERVEZ LES VALEURS PAR DEFAUT PROPOSEES PAR
     LE PROGRAMME.
  SI VOUS REPONDEZ H LES VALEURS PAR DEFAUT SONT AFFICHEES AINSI QUE
     LEUR SIGNIFICATION.
  SI VOUS REPONDEZ Y VOUS POUVEZ CHANGER CERTAINS PARAMETRES QUI SONT LES
     SUIVANTS.
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  DMAT  VALEUR NEGATIVE POUR UN MATCH. POUR L AUGMENTER SAISIR UNE
        VALEUR INFERIEURE (EX -2,-3)
        (VALEUR PAR DEFAUT -1)
  DREP  VALEUR POSITIVE POUR UN MISMATCH. POUR L AUGMENTER SAISIR UNE
        VALEUR SUPERIEURE ET INVERSEMENT.
        (VALEUR PAR DEFAUT 2)
  DEL   VALEUR POSITIVE POUR UNE INSERTION.  CF PRECEDEMMENT.
        (VALEUR PAR DEFAUT 3)
  MAXD  VALEUR MAXIMALE POUR LAQUELLE LES ALIGNEMENTS SONT EDITES.
        POUR L AUGMENTER SAISIR UNE VALEUR INFERIEURE (EX -25,-30)
        (VALEUR PAR DEFAUT -20)
        LES VALEURS PAR DEFAUT SUPPOSENT QUE L ON EDITERA DES
        ALIGNEMENTS DE LONGUEUR SUPERIEURE A 20 NUCLEOTIDES EN COMPTANT
        -1 POUR UN MATCH, 2 POUR UN MISMATCH, 3 POUR UNE DELETION.
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        REMARQUES IMPORTANTES.
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        LA LONGUEUR DE LA PREMIERE SEQUENCE EST LIMITEE A 3000 BP.
        LA LONGUEUR DE LA SECONDE SEQUENCE EST LIMITEE A 10000 BP.
.       CEPENDANT DANS LE CAS OU LES SEQUENCES SONT SUPERIEURES A CES
        LIMITES LE PROGRAMME ITERE AUTOMATIQUEMENT LE LONG DE CES
        SEQUENCES PAR PAS DE 3000 OU 10000.
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