CE PROGRAMME PERMET DE DETERMINER DANS UNE SEQUENCE DE PROTEINE : I. UNE HOMOLOGIE PARTIELLE (OU TOTALE) DE COMPOSITION AVEC UNE COMPOSITION INTRODUITE (OPTION C) II. UN PEPTIDE DE MASSE MOLECULAIRE DONNE (AVEC UNE CERTAINE PRECISION). CECI PERMET D ASSIGNER LES PICS DE SPECTRO DE MASSE, EN PARTICULIER - EXECUTION - Q. NOM DE LA SEQUENCE (Voir Explications generales) - Q. POSITION DU PREMIER ACIDE NO = RETURN=1 FIN =-1 Q. POSITION DU DERNIER ACIDE NO = - SEQUENCE ZASYN DERNIER RESIDUE = 1 DERNIER RESIDUE = 234 . I. RECHERCHE EN COMPOSITION(C) EN MASSE(M) M/C C (Rtn) ---------------------------------------- - Q. ENTREZ LA COMPOSITION DE LA SEQUENCE RECHERCHEE ENTREZ LA LETTRE PUIS LE NOMBRE (RETURN = FIN) Exemple : A (Rtn) 1 (Rtn) .... (Rtn) F 0. L 1. I 0. M 0. V 0. S 2. P 0. T 0. A 1. Y 0. * 0. H 0. Q 0. N 0. K 1. D 1. E 0. C 0. W 0. R 1. G 0. - 0. NOMBRE DE RESIDUES = 7 - Q. LONGUEUR DE LA SOUS-SEQUENCE -- Q. POURCENTAGE D HOMOLOGIE LE POURCENTAGE EN COMPOSITION DOIT ETRE COMPRIS ENTRE ZERO ET UNE VALEUR COMPRISE ENTRE 100 FOIS LE RAPPORT NOMBRE DE RESIDUES/LONGUEUR DE LA SOUS-SEQUENCE. - 225 - 236 6. / 12 50.00 SGLQQWDISRDA 264 - 275 6. / 12 50.00 SFKNLCDKRGDS - II. RECHERCHE EN COMPOSITION(C) EN MASSE(M) M/C M (Rtn) ---------------------------------------- . MASSE MOLECULAIRE 800 (Rtn) PRECISION EN % .2 (Rtn) ZMRSEC 1 677 Masse = 800.00 Preci = 0.20 % . 3 9 7 798.51 800.00 -1.49 QVAKKIL 49 56 8 800.31 800.00 0.31 ICADDAHG 58 64 7 799.44 800.00 -0.56 PIMLKAQ 173 180 8 801.40 800.00 1.40 EPKSVVSG 211 217 7 800.39 800.00 0.39 LQEQVAN .