RANDOMISATION D UNE SEQUENCE Ce programme permet soit de generer une sequence au hasard, soit de permuter une sequence deja existante, ceci sur des sequences nucleiques ou proteines : La generation au hasard tient compte des pourcentages en bases ou en residus. GENERATION D UNE SEQUENCE NUCLEIQUE AU HASARD : =============================================== GENERATION AU HASARD D'UNE SEQUENCE (G) RANDOMISATION D'UNE SEQUENCE EXISTANTE (R) RETURN = FIN G SEQUENCE PROTEIQUE ? (O/N) LONGUEUR DE LA SEQUENCE ? (RETURN = FIN) 1000 POURCENTAGE DE A (0-100) (RETURN= 25.00) POURCENTAGE DE C (0-100) (RETURN= 25.00) POURCENTAGE DE G (0-100) (RETURN= 25.00) POURCENTAGE DE T (0-100) (RETURN= 25.00) NOMBRE DE RANDOMISATION ? (def= 5) EDITION ? (O/N) O 10 20 30 40 50 60 CTGGACACTC ACTATCGGGG ACCCGGTCAT TTCACGAAGG CTCATTGCGA GCGTTGTACG 70 80 90 100 110 120 ACGCATACAA ATCGGAAAAG TGCCCCATAG CGGGAGAGGA CGCAACGATC GCGCACGTGG 130 140 150 160 170 180 TACACGTATC GTCAATCAAG ACTGGTACGG GGTCATTTTA ATGGCACGTT ACCATAGGGT NOM DU FICHIER EN SORTIE ? (8 CAR MAX) RETURN=FIN essai1 GENERATION D UNE SEQUENCE PROTEIQUE AU HASARD : =============================================== GENERATION AU HASARD D'UNE SEQUENCE (G) RANDOMISATION D'UNE SEQUENCE EXISTANTE (R) RETURN = FIN G SEQUENCE PROTEIQUE ? (O/N) O LONGUEUR DE LA SEQUENCE ? (RETURN = FIN) 100 POURCENTAGE DE A (0-100) (RETURN= 5.00) POURCENTAGE DE C (0-100) (RETURN= 5.00) POURCENTAGE DE D (0-100) (RETURN= 5.00) POURCENTAGE DE E (0-100) (RETURN= 5.00) POURCENTAGE DE F (0-100) (RETURN= 5.00) POURCENTAGE DE W (0-100) (RETURN= 5.00) POURCENTAGE DE Y (0-100) (RETURN= 5.00) NOMBRE DE RANDOMISATION ? (def= 5) EDITION ? (O/N) NOM DU FICHIER EN SORTIE ? (8 CAR MAX) RETURN=FIN essai2 RANDOMISATION D UNE SEQUENCE NUCLEIQUE ====================================== GENERATION AU HASARD D'UNE SEQUENCE (G) RANDOMISATION D'UNE SEQUENCE EXISTANTE (R) RETURN = FIN R LA SEQUENCE EST-ELLE DEJA EN MEMOIRE ? (O/N) N TYPE DE DONNEE PERSONNELLE (P) - EMBL (E) - GENBANK (G) - RETURN = MENU G MNEMO DE LA SEQ (16 C MAX) RETURN = RETOUR CHOIX PRECEDENT pbr322 Position Debut NO (RETURN = 1 -1 = RETOUR AU MENU) Position Fin NO (RETURN = 4363) NOMBRE DE RANDOMISATION ? (def= 5) EDITION ? (O/N) N NOM DU FICHIER EN SORTIE ? (8 CAR MAX) RETURN=FIN essai3 RANDOMISATION D UNE SEQUENCE PROTEIQUE ====================================== GENERATION AU HASARD D'UNE SEQUENCE (G) RANDOMISATION D'UNE SEQUENCE EXISTANTE (R) RETURN = FIN R LA SEQUENCE EST-ELLE DEJA EN MEMOIRE ? (O/N) TYPE DE DONNEE PERSONNELLE (P) - NBRF (N) RETURN = MENU N MNEMO DE LA SEQ (16 C MAX) RETURN = RETOUR CHOIX PRECEDENT CCHO Position Debut NO (RETURN = 1 -1 = RETOUR AU MENU) Position Fin NO (RETURN = 104) NOMBRE DE RANDOMISATION ? (def= 5) EDITION ? (O/N) O 10 20 30 40 50 60 KKTEQDFEKI TGGMGYHPKL INEHKTQTVE AYNFINHTLA IRGMGKYDQT KGNGNLGLIT 70 80 90 100 110 120 ADKKGATGAK FKKKKPCTKV KEGGCIPAWK EPTLRKFLEE EYVK NOM DU FICHIER EN SORTIE ? (8 CAR MAX) RETURN=FIN