Ce programme applique l'algorithme de Garnier et Robson(1) pour prédire de      
manière non ambiguë les quatre formes de structures secondaires que peut        
prendre chaque résidu d'acide aminé d'une protéine :                            
    Hélice alpha (H)         Feuillet bêta (E)                                  
    Bêta-turn    (T)         Désordonnée   (C)                                  
.                                                                               
La détermination d'un paramètre d information (DECINAT) pour chacune des 4      
structures est effectuée pour chaque résidu J par sommation des contributions   
des résidus J-8 à J+8. La structure choisie pour le résidu J est celle qui a
la valeur la plus élevée parmi les 4 paramètres d'information.            
Dans une première passe, le calcul se fait sans addition de constante de        
décision. Le programme definit selon Taylor et Thornton(2) le type de structure 
globale de la protéine :                                                         
Le programme propose 2 constantes de decision pour les structures alpha et 
bêta, ce qui permet d'affiner la prédiction :                
.                                                                               
                                                          DC ALPHA  DC BETA     
.                                                                               
TOUT ALPHA               : BETA  < 15%                       ---     ---        
TOUT BETA                : ALPHA < 15%                       ---     ---        
POSSIBLE BETA/ALPHA TYPE : BETA  > 15%   15 < ALPHA < 35%    100       0        
PROBABLE BETA/ALPHA TYPE : BETA  > 15%        ALPHA > 35%      0      20        
.                                                                               
Dans l'article original, Garnier et Robson proposent une autre classification :
   
.                                                                               
  % STRUCTURE SECONDAIRE (ALPHA + BETA)                    DC ALPHA  DC BETA    
          MOINS DE 20%                                       158      50        
        ENTRE 20 ET 50 %                                     -75    -87.5       
          PLUS  DE 50%                                      -100    -87.5       
.                                                                               
(1) J. Mol. biol. 1978, 120, 97-120.                                            
(2) J. Mol. biol. 1984, 173, 487-514.