analyze utilise plusieurs programmes des packages linkage/fastlink. Par defaut ce sera linkage version 5.2 de M. Lathrop. Si vous desirez utiliser fastlink, il faut le specifier dans votre path apres etre entre dans l'environnement linkage en tapant (ou copier-coller) la commande suivante : export PATH=/env/infobiogen/pack/linkages/f30/bin:$PATH pour la version lente. ou bien export PATH=/env/infobiogen/pack/linkages/ff30/bin:$PATH pour la version rapide. Ceci devra etre tape dans chaque terminal ou vous travaillerez. Le programme downfreq est extremement utile pour reduire le nombre d'alleles, ce qui peut vous permettre d'effectuer des calculs (linkmap) impossibles, ou difficiles et tres longs, avant reduction.