Le serveur Infobiogen maintient et met à la disposition de ses utilisateurs un ensemble de bases de données génétiques régulièrement actualisées, comprenant :
les grandes banques généralistes internationales de séquences nucléiques (EMBL et Genbank) et protéiques (Swissprot et Nbrf-pir)
des banques spécialistes : banques de motifs, de données structurales ou de données cartographiques
les données génomiques, moins structurées que les précédentes, issues directement du séquençage :
les séquences génomiques des microorganismes complets, par ailleurs intégrées dans Genbank et l'Embl
les séquences génomiques des microorganismes incomplets, encore en cours de séquençage.
les séquence du GoldenPath, correspondant aux séquences de chacun des chromosomes du génome humain
Ces données sont disponibles sur le site FTP d'Infobiogen.
En outre, elles peuvent être exploitées de deux manières possibles.
Les données de ces banques sont consultables et peuvent être extraites via le système d'interrogation SRS.
Ces données peuvent être par ailleurs traitées à l'intérieur des programmes d'analyse de séquences installés sur le site.
Interrogation / consultation des banques de données
Les systèmes d'interrogation des bases de données sont des logiciels capables de lire et d'extraire l'information de la base selon les critères choisis. SRS
(en mode anonyme) et ACNUC (en mode authentifié) permettent d'interroger la totalité des banques d'Infobiogen en proposant une interface de consultation multicritère.
